現代の都市では、衛生管理の徹底や除菌の習慣が広がる一方で、環境中の微生物の多様性が著しく低下している。無害な微生物まで減少することで、病原菌など特定の微生物のみが繁殖しやすくなり、感染症の拡大や薬剤耐性菌が生まれる要因となっている。また、空調設備の普及や密閉構造の建物が増え、土壌や植物などからさまざまな微生物が室内に取り込まれにくく、自然由来の微生物と触れる機会が減少した。人が多様な微生物に接する機会が減ることで、免疫機能の発達や健康維持にも影響がおよぶと考えられている。